Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem17Q8K0U3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem17Q8K0U3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem17Q8K0U3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem17Q8K0U3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem17Q8K0U3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem17Q8K0U3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tmem17Q8K0U3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmem17Q8K0U3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem17Q8K0U3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem17Q8K0U3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms