Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc47a1Q8K0H1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc47a1Q8K0H1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc47a1Q8K0H1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc47a1Q8K0H1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc47a1Q8K0H1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc47a1Q8K0H1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc47a1Q8K0H1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc47a1Q8K0H1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc47a1Q8K0H1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc47a1Q8K0H1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc47a1Q8K0H1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc47a1Q8K0H1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc47a1Q8K0H1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc47a1Q8K0H1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc47a1Q8K0H1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc47a1Q8K0H1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc47a1Q8K0H1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc47a1Q8K0H1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc47a1Q8K0H1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc47a1Q8K0H1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc47a1Q8K0H1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc47a1Q8K0H1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc47a1Q8K0H1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms