Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LgsnQ8CIX8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LgsnQ8CIX8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LgsnQ8CIX8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LgsnQ8CIX8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LgsnQ8CIX8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LgsnQ8CIX8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LgsnQ8CIX8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LgsnQ8CIX8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LgsnQ8CIX8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LgsnQ8CIX8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LgsnQ8CIX8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LgsnQ8CIX8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LgsnQ8CIX8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LgsnQ8CIX8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms