Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ5

Slc22a12, Solute carrier family 22 member 12, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a12Q8CFZ5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc22a12Q8CFZ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc22a12Q8CFZ5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a12Q8CFZ5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a12Q8CFZ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a12Q8CFZ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc22a12Q8CFZ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc22a12Q8CFZ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc22a12Q8CFZ5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms