Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFG9

C1rb, Complement C1r-B subcomponent, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1rbQ8CFG9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1rbQ8CFG9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1rbQ8CFG9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1rbQ8CFG9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1rbQ8CFG9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1rbQ8CFG9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1rbQ8CFG9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1rbQ8CFG9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1rbQ8CFG9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1rbQ8CFG9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1rbQ8CFG9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1rbQ8CFG9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1rbQ8CFG9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1rbQ8CFG9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1rbQ8CFG9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1rbQ8CFG9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1rbQ8CFG9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1rbQ8CFG9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1rbQ8CFG9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1rbQ8CFG9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms