Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ9

4932414N04Rik, RIKEN cDNA 4932414N04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932414N04RikQ8CEQ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4932414N04RikQ8CEQ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4932414N04RikQ8CEQ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4932414N04RikQ8CEQ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4932414N04RikQ8CEQ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms