Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms