Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
9030612E09RikQ8CE20 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
9030612E09RikQ8CE20 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
9030612E09RikQ8CE20 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
9030612E09RikQ8CE20 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
9030612E09RikQ8CE20 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms