Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CrebrfQ8CDG5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CrebrfQ8CDG5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CrebrfQ8CDG5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CrebrfQ8CDG5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CrebrfQ8CDG5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CrebrfQ8CDG5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CrebrfQ8CDG5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CrebrfQ8CDG5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CrebrfQ8CDG5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CrebrfQ8CDG5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CrebrfQ8CDG5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CrebrfQ8CDG5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CrebrfQ8CDG5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CrebrfQ8CDG5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CrebrfQ8CDG5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CrebrfQ8CDG5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CrebrfQ8CDG5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CrebrfQ8CDG5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms