Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt222Q8CCX5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt222Q8CCX5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt222Q8CCX5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt222Q8CCX5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt222Q8CCX5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt222Q8CCX5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt222Q8CCX5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt222Q8CCX5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt222Q8CCX5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt222Q8CCX5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt222Q8CCX5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt222Q8CCX5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt222Q8CCX5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt222Q8CCX5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt222Q8CCX5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt222Q8CCX5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt222Q8CCX5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms