Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsun3Q8CCT7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsun3Q8CCT7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsun3Q8CCT7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsun3Q8CCT7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsun3Q8CCT7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsun3Q8CCT7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsun3Q8CCT7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsun3Q8CCT7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nsun3Q8CCT7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nsun3Q8CCT7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsun3Q8CCT7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsun3Q8CCT7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsun3Q8CCT7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsun3Q8CCT7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsun3Q8CCT7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsun3Q8CCT7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsun3Q8CCT7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsun3Q8CCT7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsun3Q8CCT7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsun3Q8CCT7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsun3Q8CCT7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsun3Q8CCT7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsun3Q8CCT7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsun3Q8CCT7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nsun3Q8CCT7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsun3Q8CCT7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsun3Q8CCT7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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