Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RybpQ8CCI5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RybpQ8CCI5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RybpQ8CCI5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RybpQ8CCI5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RybpQ8CCI5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RybpQ8CCI5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms