Protein–RNA interactions for Protein: Q8C811

Slc35e2, Solute carrier family 35 member E2, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e2Q8C811 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35e2Q8C811 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35e2Q8C811 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc35e2Q8C811 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc35e2Q8C811 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc35e2Q8C811 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35e2Q8C811 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35e2Q8C811 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35e2Q8C811 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35e2Q8C811 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc35e2Q8C811 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc35e2Q8C811 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc35e2Q8C811 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc35e2Q8C811 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc35e2Q8C811 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc35e2Q8C811 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc35e2Q8C811 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc35e2Q8C811 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc35e2Q8C811 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc35e2Q8C811 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms