Protein–RNA interactions for Protein: Q8C753

Kiaa0556, Protein KIAA0556, mousemouse

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa0556Q8C753 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Kiaa0556Q8C753 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Kiaa0556Q8C753 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Kiaa0556Q8C753 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Kiaa0556Q8C753 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Kiaa0556Q8C753 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Kiaa0556Q8C753 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Kiaa0556Q8C753 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Kiaa0556Q8C753 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Kiaa0556Q8C753 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kiaa0556Q8C753 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kiaa0556Q8C753 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kiaa0556Q8C753 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kiaa0556Q8C753 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kiaa0556Q8C753 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Kiaa0556Q8C753 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Kiaa0556Q8C753 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kiaa0556Q8C753 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kiaa0556Q8C753 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kiaa0556Q8C753 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Kiaa0556Q8C753 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Kiaa0556Q8C753 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Kiaa0556Q8C753 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Kiaa0556Q8C753 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Kiaa0556Q8C753 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Kiaa0556Q8C753 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Kiaa0556Q8C753 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Kiaa0556Q8C753 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kiaa0556Q8C753 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kiaa0556Q8C753 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kiaa0556Q8C753 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Kiaa0556Q8C753 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Kiaa0556Q8C753 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Kiaa0556Q8C753 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Kiaa0556Q8C753 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Kiaa0556Q8C753 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Kiaa0556Q8C753 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Kiaa0556Q8C753 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Kiaa0556Q8C753 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Kiaa0556Q8C753 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Kiaa0556Q8C753 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Kiaa0556Q8C753 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Kiaa0556Q8C753 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kiaa0556Q8C753 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kiaa0556Q8C753 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kiaa0556Q8C753 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Kiaa0556Q8C753 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Kiaa0556Q8C753 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kiaa0556Q8C753 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Kiaa0556Q8C753 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kiaa0556Q8C753 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kiaa0556Q8C753 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kiaa0556Q8C753 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Kiaa0556Q8C753 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Kiaa0556Q8C753 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Kiaa0556Q8C753 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Kiaa0556Q8C753 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Kiaa0556Q8C753 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Kiaa0556Q8C753 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Kiaa0556Q8C753 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Kiaa0556Q8C753 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Kiaa0556Q8C753 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kiaa0556Q8C753 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kiaa0556Q8C753 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kiaa0556Q8C753 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Kiaa0556Q8C753 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Kiaa0556Q8C753 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Kiaa0556Q8C753 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Kiaa0556Q8C753 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kiaa0556Q8C753 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Kiaa0556Q8C753 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kiaa0556Q8C753 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kiaa0556Q8C753 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kiaa0556Q8C753 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms