Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp5Q8BX09 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbbp5Q8BX09 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbbp5Q8BX09 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rbbp5Q8BX09 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbbp5Q8BX09 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbbp5Q8BX09 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbbp5Q8BX09 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbbp5Q8BX09 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms