Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Catsper4Q8BVN3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Catsper4Q8BVN3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Catsper4Q8BVN3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Catsper4Q8BVN3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Catsper4Q8BVN3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Catsper4Q8BVN3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms