Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcl3Q8BVF2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdcl3Q8BVF2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pdcl3Q8BVF2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcl3Q8BVF2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcl3Q8BVF2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcl3Q8BVF2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcl3Q8BVF2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcl3Q8BVF2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcl3Q8BVF2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcl3Q8BVF2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcl3Q8BVF2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcl3Q8BVF2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcl3Q8BVF2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcl3Q8BVF2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcl3Q8BVF2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcl3Q8BVF2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcl3Q8BVF2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.6 ms