Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c4Q8BMQ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c4Q8BMQ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c4Q8BMQ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c4Q8BMQ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c4Q8BMQ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c4Q8BMQ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c4Q8BMQ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c4Q8BMQ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gtf3c4Q8BMQ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf3c4Q8BMQ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c4Q8BMQ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms