Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim19Q80ZU4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Smim19Q80ZU4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Smim19Q80ZU4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim19Q80ZU4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim19Q80ZU4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms