Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc27Q80YS5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc27Q80YS5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc27Q80YS5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc27Q80YS5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc27Q80YS5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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