Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Kdm5bQ80Y84 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Kdm5bQ80Y84 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Kdm5bQ80Y84 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Kdm5bQ80Y84 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Kdm5bQ80Y84 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Kdm5bQ80Y84 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Kdm5bQ80Y84 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Kdm5bQ80Y84 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Kdm5bQ80Y84 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Kdm5bQ80Y84 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Kdm5bQ80Y84 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Kdm5bQ80Y84 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Kdm5bQ80Y84 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Kdm5bQ80Y84 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Kdm5bQ80Y84 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5bQ80Y84 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5bQ80Y84 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5bQ80Y84 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5bQ80Y84 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm5bQ80Y84 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Kdm5bQ80Y84 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Kdm5bQ80Y84 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Kdm5bQ80Y84 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Kdm5bQ80Y84 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Kdm5bQ80Y84 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Kdm5bQ80Y84 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Kdm5bQ80Y84 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Kdm5bQ80Y84 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5bQ80Y84 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5bQ80Y84 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Kdm5bQ80Y84 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Kdm5bQ80Y84 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Kdm5bQ80Y84 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Kdm5bQ80Y84 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Kdm5bQ80Y84 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Kdm5bQ80Y84 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5bQ80Y84 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5bQ80Y84 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Kdm5bQ80Y84 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Kdm5bQ80Y84 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Kdm5bQ80Y84 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Kdm5bQ80Y84 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Kdm5bQ80Y84 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Kdm5bQ80Y84 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Kdm5bQ80Y84 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Kdm5bQ80Y84 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Kdm5bQ80Y84 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kdm5bQ80Y84 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Kdm5bQ80Y84 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Kdm5bQ80Y84 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Kdm5bQ80Y84 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Kdm5bQ80Y84 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5bQ80Y84 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Kdm5bQ80Y84 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Kdm5bQ80Y84 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5bQ80Y84 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms