Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nrde2Q80XC6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrde2Q80XC6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrde2Q80XC6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nrde2Q80XC6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nrde2Q80XC6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms