Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Cul9Q80TT8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cul9Q80TT8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cul9Q80TT8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cul9Q80TT8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cul9Q80TT8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cul9Q80TT8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cul9Q80TT8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cul9Q80TT8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cul9Q80TT8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cul9Q80TT8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cul9Q80TT8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Cul9Q80TT8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
Cul9Q80TT8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cul9Q80TT8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cul9Q80TT8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cul9Q80TT8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cul9Q80TT8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Cul9Q80TT8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cul9Q80TT8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cul9Q80TT8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Cul9Q80TT8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cul9Q80TT8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cul9Q80TT8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cul9Q80TT8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cul9Q80TT8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Cul9Q80TT8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Cul9Q80TT8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cul9Q80TT8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cul9Q80TT8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Cul9Q80TT8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cul9Q80TT8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Cul9Q80TT8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cul9Q80TT8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Cul9Q80TT8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cul9Q80TT8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Cul9Q80TT8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cul9Q80TT8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cul9Q80TT8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cul9Q80TT8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Cul9Q80TT8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Cul9Q80TT8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cul9Q80TT8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cul9Q80TT8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Cul9Q80TT8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cul9Q80TT8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cul9Q80TT8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cul9Q80TT8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cul9Q80TT8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cul9Q80TT8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cul9Q80TT8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cul9Q80TT8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cul9Q80TT8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cul9Q80TT8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cul9Q80TT8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms