Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim17Q7TPM3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim17Q7TPM3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim17Q7TPM3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim17Q7TPM3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim17Q7TPM3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim17Q7TPM3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim17Q7TPM3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim17Q7TPM3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim17Q7TPM3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim17Q7TPM3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim17Q7TPM3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim17Q7TPM3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim17Q7TPM3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim17Q7TPM3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim17Q7TPM3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms