Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SyncripQ7TMK9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SyncripQ7TMK9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SyncripQ7TMK9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SyncripQ7TMK9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SyncripQ7TMK9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms