Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed3Q78IS1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed3Q78IS1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed3Q78IS1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmed3Q78IS1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmed3Q78IS1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms