Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp34Q6ZQ93 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp34Q6ZQ93 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp34Q6ZQ93 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp34Q6ZQ93 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp34Q6ZQ93 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp34Q6ZQ93 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp34Q6ZQ93 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp34Q6ZQ93 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp34Q6ZQ93 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp34Q6ZQ93 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp34Q6ZQ93 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp34Q6ZQ93 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp34Q6ZQ93 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp34Q6ZQ93 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp34Q6ZQ93 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp34Q6ZQ93 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp34Q6ZQ93 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp34Q6ZQ93 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp34Q6ZQ93 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp34Q6ZQ93 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp34Q6ZQ93 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp34Q6ZQ93 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp34Q6ZQ93 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp34Q6ZQ93 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp34Q6ZQ93 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp34Q6ZQ93 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp34Q6ZQ93 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Usp34Q6ZQ93 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp34Q6ZQ93 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp34Q6ZQ93 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms