Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot1Q6ZQ08 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot1Q6ZQ08 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cnot1Q6ZQ08 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot1Q6ZQ08 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot1Q6ZQ08 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot1Q6ZQ08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot1Q6ZQ08 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot1Q6ZQ08 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot1Q6ZQ08 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot1Q6ZQ08 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot1Q6ZQ08 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot1Q6ZQ08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot1Q6ZQ08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot1Q6ZQ08 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot1Q6ZQ08 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot1Q6ZQ08 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot1Q6ZQ08 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms