Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tlr13Q6R5N8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlr13Q6R5N8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlr13Q6R5N8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tlr13Q6R5N8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tlr13Q6R5N8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlr13Q6R5N8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlr13Q6R5N8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlr13Q6R5N8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tlr13Q6R5N8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tlr13Q6R5N8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tlr13Q6R5N8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tlr13Q6R5N8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tlr13Q6R5N8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tlr13Q6R5N8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tlr13Q6R5N8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tlr13Q6R5N8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tlr13Q6R5N8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tlr13Q6R5N8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tlr13Q6R5N8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tlr13Q6R5N8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr13Q6R5N8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr13Q6R5N8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr13Q6R5N8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr13Q6R5N8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tlr13Q6R5N8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tlr13Q6R5N8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms