Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhb9Q6PB60 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bhlhb9Q6PB60 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bhlhb9Q6PB60 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.7 ms