Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Gapvd1Q6PAR5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Gapvd1Q6PAR5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Gapvd1Q6PAR5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Gapvd1Q6PAR5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Gapvd1Q6PAR5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Gapvd1Q6PAR5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Gapvd1Q6PAR5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
Gapvd1Q6PAR5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Gapvd1Q6PAR5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Gapvd1Q6PAR5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Gapvd1Q6PAR5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Gapvd1Q6PAR5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Gapvd1Q6PAR5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Gapvd1Q6PAR5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Gapvd1Q6PAR5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Gapvd1Q6PAR5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Gapvd1Q6PAR5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Gapvd1Q6PAR5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Gapvd1Q6PAR5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Gapvd1Q6PAR5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Gapvd1Q6PAR5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Gapvd1Q6PAR5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Gapvd1Q6PAR5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Gapvd1Q6PAR5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Gapvd1Q6PAR5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Gapvd1Q6PAR5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Gapvd1Q6PAR5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Gapvd1Q6PAR5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Gapvd1Q6PAR5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Gapvd1Q6PAR5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Gapvd1Q6PAR5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Gapvd1Q6PAR5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Gapvd1Q6PAR5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Gapvd1Q6PAR5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Gapvd1Q6PAR5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Gapvd1Q6PAR5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Gapvd1Q6PAR5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Gapvd1Q6PAR5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Gapvd1Q6PAR5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Gapvd1Q6PAR5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Gapvd1Q6PAR5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Gapvd1Q6PAR5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Gapvd1Q6PAR5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Gapvd1Q6PAR5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Gapvd1Q6PAR5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Gapvd1Q6PAR5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Gapvd1Q6PAR5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Gapvd1Q6PAR5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Gapvd1Q6PAR5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Gapvd1Q6PAR5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Gapvd1Q6PAR5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Gapvd1Q6PAR5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Gapvd1Q6PAR5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Gapvd1Q6PAR5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Gapvd1Q6PAR5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Gapvd1Q6PAR5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Gapvd1Q6PAR5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Gapvd1Q6PAR5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Gapvd1Q6PAR5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Gapvd1Q6PAR5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Gapvd1Q6PAR5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Gapvd1Q6PAR5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Gapvd1Q6PAR5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Gapvd1Q6PAR5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Gapvd1Q6PAR5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Gapvd1Q6PAR5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Gapvd1Q6PAR5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Gapvd1Q6PAR5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Gapvd1Q6PAR5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Gapvd1Q6PAR5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Gapvd1Q6PAR5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Gapvd1Q6PAR5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Gapvd1Q6PAR5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Gapvd1Q6PAR5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Gapvd1Q6PAR5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Gapvd1Q6PAR5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Gapvd1Q6PAR5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Gapvd1Q6PAR5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Gapvd1Q6PAR5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Gapvd1Q6PAR5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Gapvd1Q6PAR5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms