Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac4Q6NZM9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hdac4Q6NZM9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac4Q6NZM9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac4Q6NZM9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac4Q6NZM9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac4Q6NZM9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac4Q6NZM9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac4Q6NZM9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac4Q6NZM9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac4Q6NZM9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac4Q6NZM9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac4Q6NZM9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac4Q6NZM9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Hdac4Q6NZM9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hdac4Q6NZM9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hdac4Q6NZM9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac4Q6NZM9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms