Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pdcd11Q6NS46 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pdcd11Q6NS46 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pdcd11Q6NS46 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pdcd11Q6NS46 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Pdcd11Q6NS46 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pdcd11Q6NS46 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pdcd11Q6NS46 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pdcd11Q6NS46 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pdcd11Q6NS46 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pdcd11Q6NS46 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pdcd11Q6NS46 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Pdcd11Q6NS46 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pdcd11Q6NS46 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pdcd11Q6NS46 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Pdcd11Q6NS46 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Pdcd11Q6NS46 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Pdcd11Q6NS46 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Pdcd11Q6NS46 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pdcd11Q6NS46 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pdcd11Q6NS46 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pdcd11Q6NS46 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pdcd11Q6NS46 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pdcd11Q6NS46 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Pdcd11Q6NS46 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Pdcd11Q6NS46 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pdcd11Q6NS46 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pdcd11Q6NS46 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pdcd11Q6NS46 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pdcd11Q6NS46 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pdcd11Q6NS46 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pdcd11Q6NS46 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pdcd11Q6NS46 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pdcd11Q6NS46 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pdcd11Q6NS46 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Pdcd11Q6NS46 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Pdcd11Q6NS46 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Pdcd11Q6NS46 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pdcd11Q6NS46 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pdcd11Q6NS46 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pdcd11Q6NS46 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pdcd11Q6NS46 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pdcd11Q6NS46 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Pdcd11Q6NS46 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Pdcd11Q6NS46 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pdcd11Q6NS46 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Pdcd11Q6NS46 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Pdcd11Q6NS46 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pdcd11Q6NS46 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pdcd11Q6NS46 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pdcd11Q6NS46 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Pdcd11Q6NS46 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Pdcd11Q6NS46 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pdcd11Q6NS46 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pdcd11Q6NS46 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms