Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt42Q6IFX2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt42Q6IFX2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt42Q6IFX2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt42Q6IFX2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt42Q6IFX2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt42Q6IFX2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt42Q6IFX2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt42Q6IFX2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt42Q6IFX2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt42Q6IFX2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt42Q6IFX2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms