Protein–RNA interactions for Protein: Q6A098

Secisbp2l, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2lQ6A098 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Secisbp2lQ6A098 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Secisbp2lQ6A098 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Secisbp2lQ6A098 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Secisbp2lQ6A098 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Secisbp2lQ6A098 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Secisbp2lQ6A098 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Secisbp2lQ6A098 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Secisbp2lQ6A098 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Secisbp2lQ6A098 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Secisbp2lQ6A098 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Secisbp2lQ6A098 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Secisbp2lQ6A098 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Secisbp2lQ6A098 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Secisbp2lQ6A098 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Secisbp2lQ6A098 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Secisbp2lQ6A098 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Secisbp2lQ6A098 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Secisbp2lQ6A098 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Secisbp2lQ6A098 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Secisbp2lQ6A098 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Secisbp2lQ6A098 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Secisbp2lQ6A098 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Secisbp2lQ6A098 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Secisbp2lQ6A098 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Secisbp2lQ6A098 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Secisbp2lQ6A098 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Secisbp2lQ6A098 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Secisbp2lQ6A098 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Secisbp2lQ6A098 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms