Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3rf1Q69ZI1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3rf1Q69ZI1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3rf1Q69ZI1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3rf1Q69ZI1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3rf1Q69ZI1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3rf1Q69ZI1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3rf1Q69ZI1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3rf1Q69ZI1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3rf1Q69ZI1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3rf1Q69ZI1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3rf1Q69ZI1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh3rf1Q69ZI1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3rf1Q69ZI1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3rf1Q69ZI1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3rf1Q69ZI1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3rf1Q69ZI1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3rf1Q69ZI1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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