Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZC8

Gpalpp1, GPALPP motifs-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpalpp1Q69ZC8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpalpp1Q69ZC8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpalpp1Q69ZC8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpalpp1Q69ZC8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpalpp1Q69ZC8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpalpp1Q69ZC8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpalpp1Q69ZC8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpalpp1Q69ZC8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpalpp1Q69ZC8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpalpp1Q69ZC8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpalpp1Q69ZC8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpalpp1Q69ZC8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpalpp1Q69ZC8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpalpp1Q69ZC8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpalpp1Q69ZC8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpalpp1Q69ZC8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpalpp1Q69ZC8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms