Protein–RNA interactions for Protein: Q68G58

Apex2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex2Q68G58 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apex2Q68G58 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apex2Q68G58 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apex2Q68G58 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apex2Q68G58 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apex2Q68G58 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apex2Q68G58 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apex2Q68G58 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apex2Q68G58 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apex2Q68G58 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Apex2Q68G58 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apex2Q68G58 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Apex2Q68G58 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apex2Q68G58 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apex2Q68G58 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apex2Q68G58 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apex2Q68G58 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apex2Q68G58 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Apex2Q68G58 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apex2Q68G58 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apex2Q68G58 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apex2Q68G58 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apex2Q68G58 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apex2Q68G58 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apex2Q68G58 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms