Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CltcQ68FD5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CltcQ68FD5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CltcQ68FD5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CltcQ68FD5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CltcQ68FD5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CltcQ68FD5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CltcQ68FD5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CltcQ68FD5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CltcQ68FD5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CltcQ68FD5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CltcQ68FD5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CltcQ68FD5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CltcQ68FD5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CltcQ68FD5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CltcQ68FD5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CltcQ68FD5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CltcQ68FD5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CltcQ68FD5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CltcQ68FD5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CltcQ68FD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CltcQ68FD5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
CltcQ68FD5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CltcQ68FD5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CltcQ68FD5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CltcQ68FD5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CltcQ68FD5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CltcQ68FD5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CltcQ68FD5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CltcQ68FD5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CltcQ68FD5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CltcQ68FD5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CltcQ68FD5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CltcQ68FD5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CltcQ68FD5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CltcQ68FD5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CltcQ68FD5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CltcQ68FD5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CltcQ68FD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CltcQ68FD5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CltcQ68FD5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CltcQ68FD5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CltcQ68FD5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CltcQ68FD5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CltcQ68FD5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CltcQ68FD5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CltcQ68FD5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CltcQ68FD5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CltcQ68FD5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CltcQ68FD5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CltcQ68FD5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CltcQ68FD5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CltcQ68FD5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CltcQ68FD5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CltcQ68FD5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CltcQ68FD5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CltcQ68FD5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CltcQ68FD5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CltcQ68FD5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CltcQ68FD5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CltcQ68FD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CltcQ68FD5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CltcQ68FD5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CltcQ68FD5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CltcQ68FD5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CltcQ68FD5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CltcQ68FD5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CltcQ68FD5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CltcQ68FD5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CltcQ68FD5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CltcQ68FD5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CltcQ68FD5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CltcQ68FD5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CltcQ68FD5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CltcQ68FD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms