Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q66JV7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q66JV7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q66JV7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q66JV7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q66JV7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Q66JV7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q66JV7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q66JV7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q66JV7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q66JV7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q66JV7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q66JV7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q66JV7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q66JV7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q66JV7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q66JV7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q66JV7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q66JV7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q66JV7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q66JV7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q66JV7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q66JV7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q66JV7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q66JV7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q66JV7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q66JV7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q66JV7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q66JV7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q66JV7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q66JV7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q66JV7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q66JV7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q66JV7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q66JV7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q66JV7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q66JV7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q66JV7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q66JV7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q66JV7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q66JV7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q66JV7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q66JV7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q66JV7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q66JV7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q66JV7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q66JV7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q66JV7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q66JV7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q66JV7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q66JV7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q66JV7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Q66JV7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q66JV7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q66JV7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q66JV7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q66JV7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q66JV7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q66JV7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q66JV7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q66JV7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q66JV7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q66JV7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q66JV7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q66JV7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q66JV7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q66JV7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Q66JV7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q66JV7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q66JV7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q66JV7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q66JV7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q66JV7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q66JV7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q66JV7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q66JV7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Q66JV7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q66JV7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q66JV7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q66JV7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q66JV7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q66JV7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q66JV7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Q66JV7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q66JV7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q66JV7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q66JV7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q66JV7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q66JV7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q66JV7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q66JV7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q66JV7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q66JV7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q66JV7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q66JV7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q66JV7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q66JV7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q66JV7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Q66JV7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q66JV7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms