Protein–RNA interactions for Protein: Q62407

Speg, Striated muscle-specific serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 3,262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpegQ62407 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpegQ62407 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpegQ62407 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpegQ62407 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SpegQ62407 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SpegQ62407 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SpegQ62407 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SpegQ62407 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SpegQ62407 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpegQ62407 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SpegQ62407 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms