Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpd52Q62393 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpd52Q62393 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpd52Q62393 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpd52Q62393 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpd52Q62393 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tpd52Q62393 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tpd52Q62393 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tpd52Q62393 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tpd52Q62393 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpd52Q62393 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpd52Q62393 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpd52Q62393 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpd52Q62393 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tpd52Q62393 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tpd52Q62393 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpd52Q62393 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpd52Q62393 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tpd52Q62393 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tpd52Q62393 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpd52Q62393 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpd52Q62393 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpd52Q62393 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tpd52Q62393 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tpd52Q62393 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tpd52Q62393 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Tpd52Q62393 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpd52Q62393 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpd52Q62393 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpd52Q62393 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpd52Q62393 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpd52Q62393 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpd52Q62393 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpd52Q62393 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpd52Q62393 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpd52Q62393 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tpd52Q62393 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpd52Q62393 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpd52Q62393 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpd52Q62393 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms