Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna11Q61716 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna11Q61716 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna11Q61716 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna11Q61716 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifna11Q61716 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna11Q61716 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna11Q61716 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna11Q61716 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna11Q61716 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna11Q61716 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna11Q61716 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna11Q61716 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna11Q61716 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms