Protein–RNA interactions for Protein: Q61711

Ibsp, Bone sialoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IbspQ61711 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IbspQ61711 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IbspQ61711 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IbspQ61711 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IbspQ61711 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
IbspQ61711 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IbspQ61711 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IbspQ61711 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IbspQ61711 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IbspQ61711 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IbspQ61711 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IbspQ61711 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IbspQ61711 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IbspQ61711 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IbspQ61711 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IbspQ61711 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IbspQ61711 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IbspQ61711 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IbspQ61711 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IbspQ61711 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IbspQ61711 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IbspQ61711 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IbspQ61711 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IbspQ61711 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IbspQ61711 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms