Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dsg1aQ61495 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Dsg1aQ61495 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dsg1aQ61495 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dsg1aQ61495 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dsg1aQ61495 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dsg1aQ61495 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dsg1aQ61495 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dsg1aQ61495 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dsg1aQ61495 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dsg1aQ61495 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dsg1aQ61495 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Dsg1aQ61495 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dsg1aQ61495 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dsg1aQ61495 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dsg1aQ61495 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dsg1aQ61495 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dsg1aQ61495 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dsg1aQ61495 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dsg1aQ61495 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dsg1aQ61495 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dsg1aQ61495 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dsg1aQ61495 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Dsg1aQ61495 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dsg1aQ61495 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dsg1aQ61495 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dsg1aQ61495 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dsg1aQ61495 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms