Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsx2Q61412 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vsx2Q61412 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vsx2Q61412 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vsx2Q61412 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vsx2Q61412 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms