Protein–RNA interactions for Protein: Q61327

Slc6a3, Sodium-dependent dopamine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a3Q61327 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a3Q61327 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc6a3Q61327 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc6a3Q61327 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc6a3Q61327 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc6a3Q61327 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a3Q61327 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a3Q61327 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a3Q61327 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a3Q61327 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a3Q61327 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a3Q61327 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a3Q61327 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc6a3Q61327 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc6a3Q61327 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc6a3Q61327 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms