Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Neurod1Q60867 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Neurod1Q60867 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Neurod1Q60867 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Neurod1Q60867 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Neurod1Q60867 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Neurod1Q60867 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Neurod1Q60867 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Neurod1Q60867 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Neurod1Q60867 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Neurod1Q60867 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Neurod1Q60867 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Neurod1Q60867 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Neurod1Q60867 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Neurod1Q60867 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Neurod1Q60867 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Neurod1Q60867 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Neurod1Q60867 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Neurod1Q60867 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Neurod1Q60867 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Neurod1Q60867 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Neurod1Q60867 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Neurod1Q60867 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Neurod1Q60867 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Neurod1Q60867 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Neurod1Q60867 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms