Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NfkbibQ60778 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NfkbibQ60778 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NfkbibQ60778 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NfkbibQ60778 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NfkbibQ60778 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NfkbibQ60778 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NfkbibQ60778 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NfkbibQ60778 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NfkbibQ60778 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NfkbibQ60778 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NfkbibQ60778 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NfkbibQ60778 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NfkbibQ60778 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NfkbibQ60778 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NfkbibQ60778 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NfkbibQ60778 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NfkbibQ60778 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NfkbibQ60778 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NfkbibQ60778 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NfkbibQ60778 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NfkbibQ60778 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NfkbibQ60778 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NfkbibQ60778 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NfkbibQ60778 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NfkbibQ60778 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NfkbibQ60778 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NfkbibQ60778 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms