Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn2dQ60773 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkn2dQ60773 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdkn2dQ60773 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkn2dQ60773 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkn2dQ60773 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkn2dQ60773 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkn2dQ60773 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms